為了加強自然地景保存與管理維護，農委會依據文化資產保存法第７９條第３項及第８４條第２項授權規定，訂定自然地景指定及廢止辦法及申請進入自然保留區許可辦法，自即日起開始施行。參照自然地景指定及廢止辦法第２條第１款規定，自然保留區須具有代表性生態體系、獨特地形及地質意義，以及基因保存永久觀察、教育研究價值。

參照申請進入自然保留區許可辦法第２條第１項及第３條第１項等規定，原住民族因為傳統祭典需要、研究機構及大專院校學術研究需要、相關團體環境教育需要、或其他經主管機關認可的特殊需要，得申請進入自然保留區。申請進入自然保留區，應填具申請書，載明進入目的、期間、範圍、人數及從事行為種類、地點等事項，經管理及主管機關許可後，才能進入。

進入自然保留區的人員，依申請進入自然保留區許可辦法第７條規定，除非經主管機關許可，禁止改變或破壞區內原有自然狀態，不得攜入非區內原有動植物、採集標本、或在區內喧鬧或干擾野生物，也不得在植物、岩石及標示牌上另加文字圖形或色帶標示、或擅自進入指定地點以外區域，更不可丟棄廢棄物污染環境。

依申請進入自然保留區許可辦法第９條規定，進入區內的人員若違反前述規定，管理機關將立即取締，主管機關並將依規定處理及廢止其進入許可；違規者三年內不得再申請進入自然保留區。農委會林務局表示，根據文化資產保存法第９８條第３款規定，未經主管機關許可而任意進入自然保留區，將處三萬元以上十五萬元以下罰鍰，呼籲民眾遵守規定。