基隆關表示，廠商進口原料加工後，若符合關稅法第６３條及外銷品沖退原料稅辦法第４條第１款規定，得於原料進口放行翌日起一年六個月內，以紙本或電子方式申辦退還進口原料稅款。原本以紙本方式申辦須檢附出口報單副本，其退稅期限內，得以扣除海關審核出口報單的行政作業日數，惟舊辦法第２３條第３項，對採電子方式申請則無扣除行政作業日數之規定。
考量透過電子方式申請退稅，廠商須待海關審核出口報單無誤，始得透過退稅系統提出申請，為保障廠商權益，新修辦法第２３條第３項因而增訂以電子方式申請者，亦得扣除海關審核出口報單日數之規定，並於同法條第４項後段，明定扣除日數之計算自出口放行之翌日起至出口報單審結之日止。新修辦法第２５條第２項則同時配合修正。