草案增訂第三章之一「網際網路之管理」，包含主管機關通知網際網路業者限制瀏覽或移除與違反該法有關網頁資料相關配合事項、網際網路業者自主監測及管理之義務、境外網際網路業者提報法律代表之義務及相關配合事項。此外，配合網際網路之管理之增訂，草案第３０條之１，明定未於期限內限制瀏覽、移除違法資訊或有關之網頁資料、未保留資料一百八十日，或未將資料提供主管機關調查之罰責。

考量查獲之相關違法物品，由主管機關令限期改善、回收、銷毀或退運之作法，所耗時間與行政成本較高，為快速處理相關違法物品，草案第２６條第１項及第２項規定，就違法物品之處理，除原令其限期改善、回收、銷毀、退運，增列或沒入銷毀其物品。同時，配合前述修正，草案第３２條第１項規定，就違法物品之處理，除原令其限期改善、回收、銷毀、退運，增列「或沒入銷毀其物品」；草案第３７條第３項增訂，違反菸害防制法第１５條第１項第２款、第３款規定，供應類菸品或其組合元件而處罰鍰者，其物品沒入銷毀之。

草案第４０條則增訂，使用類菸品或其組合元件及未依菸害防制法第７條第１項或第２項規定，經核定通過健康風險評估審查之指定菸品或其必要之組合元件者，其物品沒入銷毀之。