法規草案 - 經濟
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經濟部公告「營利事業適用生技醫藥公司股東投資抵減辦法」修正草案(原名稱:營利事業適用生技新藥公司股東投資抵減辦法)
2022-05-30 [ 評論數 0 篇]
法規名稱:營利事業適用生技醫藥公司股東投資抵減辦法
公告文號:經授工字第 11120415831  號
資料來源:行政院公報 第 28 卷 99 期
預告終止日:中華民國 111  年 6  月 29 日
營利事業適用生技新藥公司股東投資抵減辦法修正草案總說明
營利事業適用生技新藥公司股東投資抵減辦法(以下簡稱本辦法),依據生技醫藥產
業發展條例(以下簡稱本條例)一百十年十二月三十日修正公布前第六條第三項之授
權,於九十七年二月二十九日訂定發布,並於一百零六年十二月八日修正發布。
本條例一百十年十二月三十日修正公布後本辦法授權依據修正為第七條第四項,另為
使適用租稅優惠措施之營利事業負擔合理納稅義務,增訂營利事業投資生技醫藥公司
每一年度得抵減總額,以不超過營利事業當年度應納營利事業所得稅額百分之五十為
限,並增訂營利事業投資受託開發製造之生技醫藥公司,應為未上市、未上櫃公司,
或自設立登記日未滿十年之上市、上櫃公司。
為配合前述修正,明確營利事業及創業投資事業適用股東投資抵減之要件、申請期限
、申請程序、施行期限、抵減率及其他相關事項,爰擬具修正草案,名稱並修正為「
營利事業適用生技醫藥公司股東投資抵減辦法」,其修正要點如下:
一、鑑於現行條文第二條至第五條定有生技新藥公司審定之相關要件、應備文件、申
    請程序等規範,而該等規範依本條例第四條第二項規定,主管機關應另定辦法規
    範,爰刪除該等條文。
二、增訂本條例第七條第一項及第三項所稱應納營利事業所得稅額之定義(修正條文
    第二條)
三、從事本條例第四條第一項第二款第二目業務之生技醫藥公司,其申請投資計畫核
    准函時,公司資格規範及其應另行檢附之文件;並鑑於本辦法修正發布日與本條
    例第七條修正生效之日(一百十一年一月一日)有落差,就該段期間中新創或增
    資之公司,其申辦期限予以規範,以維業者權益。(修正條文第三條)
四、就本條例一百十一年一月一日修正生效前已取得審定函之公司,其申請適用本辦
    法之情形予以明定,並就其營利事業股東適用本辦法抵減營利事業所得稅之限額
    ,予以規範。(修正條文第四條)
五、配合加工出口區之更名及公司如跨二區以上執行投資計畫且未購置機械、設備者
    ,明定核發完成證明之行政機關。(修正條文第六條)
六、公司申請核發完成證明期間遭遇相關不可抗力災害之情形,就災害項目予以增訂
    。(修正條文第九條)
七、配合醫療器材管理法自一百十年五月一日施行,增訂該法律為生技醫藥公司投資
    計畫之試驗項目應符合之法令;並就被撤銷或廢止審定函之公司,明定稅捐稽徵
    機關應行之追繳行為。(修正條文第十條)
八、明定本辦法之施行日期。(修正條文第十二條)


第 1 條    本辦法依生技醫藥產業發展條例(以下簡稱本條例)第七條第四項規定訂
           定之。

第 2 條    本條例第七條第一項用詞,定義如下:
           一、創立:指於本條例施行後,依法完成公司設立登記。
           二、擴充:指於本條例施行後,依法完成增資變更登記。
           三、原始認股:指發起設立時,發起人以現金所認股份,或增資擴展時,
               股東以現金認購增資擴展之股份。
           四、應募:指募集設立或增資擴展時之應募股份及其承銷期間購買之股票
               ;公司如係減資後增資,除該減資行為係全數為彌補虧損外,其增資
               金額應大於彌補虧損以外之減資金額。
           五、認股或應募股票成為記名股東達三年以上:指股東繳納股票價款之當
               日起,連續持有三年以上者。
           六、有應納營利事業所得稅之年度:指股東之所得稅結算申報有應納營利
               事業所得稅額,或經稅捐稽徵機關核定有應納營利事業所得稅額之年
               度。
           七、抵減各年度應納營利事業所得稅額:指抵減稅捐稽徵機關核定之各年
               度營利事業課稅所得額按所得稅法規定稅率計算之應納稅額,及稅捐
               稽徵機關核定之上一年度未分配盈餘按所得稅法規定稅率計算之應加
               徵稅額。

第 3 條    生技醫藥公司申請適用本條例第七條之投資抵減,新投資創立者應自公司
           設立登記之次日起六個月內;增資擴充者應自辦理增資,並於公司變更登
           記之次日起六個月內,檢具下列文件,向經濟部(以下簡稱本部)申請核
           發生技醫藥投資計畫核准函:
           一、公司設立登記表或公司變更登記表。
           二、新投資創立公司原始股東名冊或該次增資擴充股東名冊,包括股東戶
               號、名稱、認股股數、認股金額等;其股東如屬創業投資事業者,並
               應檢附足資證明經營創業投資事業之證明文件。
           三、投資計畫書,包括投資計畫目的、投資項目、經營團隊、研究發展團
               隊與其職掌、項目製程或研究發展流程、建廠或擴廠時間表、研究發
               展開始作業及項目開始銷售或開始提供服務之時間表。
           四、生技醫藥公司審定函。
           五、申請當年度生技醫藥專職研究發展人員學歷證明書與其實際從事生技
               醫藥研究發展內容職掌及佐證資料。
           六、議決該投資計畫增資之股東會或董事會會議紀錄影本;屬新投資創立
               者,為發起人會議紀錄影本。
           生技醫藥公司屬從事本條例第四條第一項第二款第二目業務者,前項申請
           以未上市、未上櫃公司,或自設立登記日起未滿十年之上市、上櫃公司為
           限,且其除檢附前項各項文件外,並應檢附申請當年度生技醫藥專職製造
           人員學歷證明書與其實際從事生技醫藥製程內容職掌及佐證資料。
           生技醫藥公司執行第一項投資計畫,其研發成果或技術供他人製造、使用
           者,應取得合理之權利金或其他合理之報酬。
           生技醫藥公司於一百十一年一月一日至本辦法一百十一年○月○日修正發
           布前,新投資創立或增資擴充者,得自本辦法一百十一年○月○日修正發
           布日起六個月內,依第一項及第二項規定辦理。
           第一項及第二項應檢具之各類證明文件屬外文者,應經當地公證或認證機
           構公證或認證,並檢具經駐外機構驗證之中文譯本。
           增資擴充之公司申請第一項生技醫藥投資計畫核准函,當次現金增資應以
           執行一個投資計畫為限。
           本部於核發第一項生技醫藥投資計畫核准函時,應副知受理核發完成證明
           機關、財政部賦稅署及公司所在地之稅捐稽徵機關。

第 4 條    營利事業原始認股或應募生技醫藥公司發行之股票,成為該公司記名股東
           達三年以上,且該生技醫藥公司未以該認股或應募金額,依其他法律規定
           申請免徵營利事業所得稅或股東投資抵減者,得以其取得該股票之價款百
           分之二十限度內,自其有應納營利事業所得稅之年度起五年內抵減各年度
           應納營利事業所得稅額。其每一年度得抵減總額,以不超過該營利事業當
           年度應納營利事業所得稅額百分之五十為限。
           前項營利事業如為創業投資事業,應由其營利事業股東按該創業投資事業
           依該項規定原可抵減之金額,依其持有該創業投資事業股權比例計算可享
           投資抵減金額,自創業投資事業成為該生技醫藥公司記名股東第四年度起
           五年內抵減各年度應納營利事業所得稅額。其每一年度得抵減總額,以不
           超過該營利事業當年度應納營利事業所得稅額百分之五十為限。
           前二項生技醫藥公司於本條例一百十年十二月三十日修正公布前,經本部
           審定、新投資創立或增資擴充並依本辦法一百十一年○月○日修正發布前
           第七條規定向本部申請核發生技新藥投資計畫核准函者,其營利事業股東
           投資抵減金額不受百分之五十限額限制。其於本條例一百十年十二月三十
           日修正公布前經本部審定且新投資創立或增資擴充,於該條例修正公布後
           向本部申請核發生技醫藥投資計畫核准函者,應依前二項規定辦理。

第 5 條    生技醫藥公司應於其營利事業股東以現金繳納股票價款之當日起滿三年後
           ,檢具下列文件,向公司所在地之稅捐稽徵機關申請核發營利事業股東投
           資抵減稅額證明書:
           一、創立或增資前、後之公司登記證明文件;如有多次增資,併同檢附投
               資計畫開始至本次增資之資本形成明細表。
           二、生技醫藥投資計畫核准函。
           三、議決該次增資之股東會或董事會會議紀錄影本;屬新投資創立者,為
               發起人會議紀錄影本。
           四、營利事業股東繳納股票價款證明文件。
           五、營利事業股東繼續持有股票達三年以上,可適用投資抵減之金額明細
               表,包括股東戶號、名稱、統一編號、認股股數、認股金額、繳款日
               期、股票編號或證券存摺、繼續持有三年以上之股數、可抵減金額及
               可抵減稅額。
           前項生技醫藥公司之營利事業股東屬創業投資事業者,該創業投資事業之
           營利事業股東,應提供下列文件,供生技醫藥公司依本條例第七條第三項
           規定,向公司所在地之稅捐稽徵機關提出前項申請:
           一、入股於該創業投資事業參與生技醫藥公司創立或擴充時起,連續三年
               期間均為該創業投資事業記名營利事業股東之名冊。
           二、前款營利事業股東於創業投資事業參與生技醫藥公司創立或擴充時,
               其持有該創業投資事業之股權比率。
           第一項生技醫藥公司經稅捐稽徵機關核發營利事業股東投資抵減稅額證明
           書後,對於原始認股或應募非屬創業投資事業之營利事業股東,連續持有
           生技醫藥公司股份達三年以上者,或前項創業投資事業之營利事業股東,
           自該創業投資事業參與生技醫藥公司創立或擴充時起,連續持有創業投資
           事業股份達三年以上者,應發給營利事業股東投資抵減稅額證明書。
           營利事業股東於辦理稅捐抵減年度之營利事業所得稅申報時,應檢具營利
           事業股東投資抵減稅額證明書,向管轄稅捐稽徵機關辦理稅捐抵減。

第 6 條    經核發生技醫藥投資計畫核准函之生技醫藥公司,應於該核准函核發之次
           日起五年內完成投資計畫,並於投資計畫完成日之次日起六個月內檢具相
           關文件,依下列規定申請核發完成證明,逾期申請者,不予受理:
           一、投資計畫之執行地點位於科學園區內之公司,向科學園區管理局為之
               。
           二、投資計畫之執行地點位於農業科技園區內之公司,向農業科技園區管
               理局為之。
           三、投資計畫之執行地點位於科技產業園區內之公司,向加工出口區管理
               處為之。
           四、投資計畫之執行地點位於直轄市內之公司,向當地直轄市政府為之;
               位於直轄市以外之公司,向本部中部辦公室為之。
           五、於前四款所定二區域以上執行投資計畫者,向機器、設備購置金額最
               高處之受理機關為之;如未購置機械、設備者,向公司所在地之受理
               機關為之。
           前項核發完成證明機關於核發完成證明時,應副知財政部賦稅署及公司所
           在地之稅捐稽徵機關。

第 7 條    經核發生技醫藥投資計畫核准函之生技醫藥公司,未能於本部核發核准函
           之次日起五年內完成投資計畫,或投資計畫項目變更者,應於期限屆滿前
           ,向本部申請延長或變更。但全程計畫完成期限不得超過六年。
           本部核定計畫延長或項目變更時,應副知核發完成證明機關、財政部賦稅
           署及公司所在地之稅捐稽徵機關。
           生技醫藥公司未能依第一項規定期限完成投資計畫者,應於期限屆滿後六
           個月內,通知本部無法完成投資計畫,本部於核復時,應副知核發完成證
           明機關、財政部賦稅署及公司所在地稅捐稽徵機關。

第 8 條    公司依第六條規定申請核發完成證明時,應檢具下列文件:
           一、設立或資本額變更登記前、後之公司登記證明文件影本;投資計畫之
               機器、設備安裝地位於科學園區、農業科技園區或科技產業園區內者
               ,為設立或資本額變更登記之公司登記證明文件或商業登記證明文件
               影本。
           二、生技醫藥投資計畫核准函影本。
           三、足資證明完成生技醫藥之研究發展、臨床前試驗、臨床試驗或田間試
               驗之證明資料、生技醫藥上市或製造許可證明。
           四、購置之全新機器、設備及技術清單、配置圖及購置該機器、設備及技
               術之統一發票影本、海關進口相關證明文件影本或會計師查核證明文
               件;無購置行為者,免附。
           五、議決該投資計畫增資之股東會或董事會會議紀錄影本;屬新投資創立
               者,為發起人會議紀錄影本。
           六、募集現金資本之相關證明文件。
           七、該投資計畫所支應之公司固定營業場所之投資、興建、各項與公司經
               營本業有關之營業成本及費用支出審查明細清單及相關文件。
           公司申請核發完成證明時,未能檢具前項第三款相關文件者,第六條核發
           完成證明機關於接獲申請案後,得請本部邀請生技醫藥公司審定辦法第二
           條第二項機關代表及學者專家召開專案會議提供諮詢意見。

第 9 條    經核發生技醫藥投資計畫核准函之生技醫藥公司,於申請核發完成證明期
           間內,經受理核發完成證明機關實地勘查,投資計畫已屬完成,於完成證
           明尚未核發前,遭受震災、風災、水災、旱災、寒害、火災、土石流、海
           嘯、瘟疫、蟲災、戰爭、核災、氣爆,或其他不可預見、不可避免之災害
           或事件,且非屬人力所能抗拒者,核發完成證明機關仍得依據原完成狀態
           ,核發其完成證明。

第 10 條   生技醫藥公司投資計畫之試驗項目應符合藥事法、農藥管理法、動物用藥
           品管理法、醫療器材管理法或其他相關法規規定;其設備安裝地點位於都
           市計畫地區者,應符合都市計畫法及都市土地使用分區管制之規定;位於
           非都市計畫地區者,應符合區域計畫法及非都市土地使用管制之規定。
           生技醫藥公司依第六條規定申請核發完成證明,經核發完成證明機關否准
           ,或依第七條第三項規定取具本部核復函,或未依第七條第三項規定通知
           本部者,應於取得否准函、核復函或第七條第三項應通知之期限屆滿之次
           日起六個月內,向所在地稅捐稽徵機關申請註銷營利事業股東投資抵減稅
           額證明書。
           生技醫藥公司取得完成證明,屬新投資創立者,於設立登記之日起七年內
           ;其屬增資擴充者,於增資變更登記之日起七年內,如有彌補虧損以外之
           減資行為,該減資部分不得適用投資抵減,應由生技醫藥公司自公司減資
           變更登記之次日起六個月內,向所在地稅捐稽徵機關申請更正或註銷營利
           事業股東投資抵減稅額證明書。
           有前二項規定之情事,且生技醫藥公司營利事業股東已依本條例第七條規
           定抵減稅額者,應補繳已抵減之稅額,並自各該年度營利事業所得稅結算
           申報期間屆滿之次日起至繳納日止,依郵政儲金一年期定期儲金固定利率
           ,按日加計利息,一併繳納。
           生技醫藥公司營利事業股東未依前項規定補繳及加計利息者,應由稅捐稽
           徵機關追繳其已抵減之稅額並依前項規定加計利息。
           生技醫藥公司經依生技醫藥公司審定辦法第四條第二項規定撤銷審定函者
           ,其股東已依本條例第七條規定抵減之稅額,或經廢止審定函者,其股東
           自不符合生技醫藥公司審定辦法第二條第一項各款情形之一之年度起,依
           本條例第七條規定抵減之稅額,應由稅捐稽徵機關追繳之,並自其股東各
           該抵減年度營利事業所得稅結算申報期間屆滿之次日起至繳納日止,依郵
           政儲金一年期定期儲金固定利率,按日加計利息,一併徵收。

第 11 條   經核發生技醫藥投資計畫核准函之生技醫藥公司,其依核准之投資計畫所
           募集之資金,以於投資計畫期間支應該投資計畫所需者為限。
           前項所稱支應該投資計畫所需者,指與該投資計畫有關之下列支出:
           一、公司固定營業場所之投資、興建、各項與公司經營本業有關之營業成
               本及費用支出。
           二、購置全新與自行開發之機器、設備及技術之支出。
           第一項所募集之資金於投資計畫期間,未全數支應該投資計畫所需者,其
           可適用營利事業股東投資抵減之金額,應按已支應該投資計畫之金額占所
           募集資金之比率計算之。
           稅捐稽徵機關於審查第二項與該投資計畫有關之支出時,對生技醫藥公司
           申報之支出內容或相關事項有疑義者,得請各中央目的事業主管機關協助
           認定。

第 12 條   本辦法自發布日施行。
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